Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LINC00301Q8NCQ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LINC00301Q8NCQ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms