Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTD1Q8N815 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTD1Q8N815 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNTD1Q8N815 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms