Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7E2

ZNF645, E3 ubiquitin-protein ligase ZNF645, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF645Q8N7E2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF645Q8N7E2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF645Q8N7E2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF645Q8N7E2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1609.3 ms