Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MSL3Q8N5Y2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MSL3Q8N5Y2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MSL3Q8N5Y2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MSL3Q8N5Y2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms