Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLGN4XQ8N0W4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN4XQ8N0W4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN4XQ8N0W4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms