Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR49Q8IV35 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR49Q8IV35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR49Q8IV35 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms