Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00523Q86TU6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00523Q86TU6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00523Q86TU6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00523Q86TU6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms