Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SV2BQ7L1I2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SV2BQ7L1I2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SV2BQ7L1I2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SV2BQ7L1I2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms