Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOM1L2Q6ZVM7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TOM1L2Q6ZVM7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOM1L2Q6ZVM7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOM1L2Q6ZVM7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms