Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM72Q6ZMU5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM72Q6ZMU5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM72Q6ZMU5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM72Q6ZMU5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms