Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCIMPQ6UWF3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCIMPQ6UWF3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCIMPQ6UWF3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms