Protein–RNA interactions for Protein: Q6RSH7

VHLL, von Hippel-Lindau-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLLQ6RSH7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VHLLQ6RSH7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.33■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VHLLQ6RSH7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VHLLQ6RSH7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms