Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHBDF2Q6PJF5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDF2Q6PJF5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDF2Q6PJF5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHBDF2Q6PJF5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDF2Q6PJF5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms