Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAVIN1Q6NZI2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAVIN1Q6NZI2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAVIN1Q6NZI2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms