Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPRIN2Q6IMN6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPRIN2Q6IMN6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPRIN2Q6IMN6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms