Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNS3Q68CZ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TNS3Q68CZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNS3Q68CZ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNS3Q68CZ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNS3Q68CZ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNS3Q68CZ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms