Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYY2

LIPM, Lipase member M, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPMQ5VYY2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPMQ5VYY2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPMQ5VYY2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPMQ5VYY2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LIPMQ5VYY2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIPMQ5VYY2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIPMQ5VYY2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPMQ5VYY2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPMQ5VYY2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms