Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf146Q5VVC0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf146Q5VVC0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf146Q5VVC0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf146Q5VVC0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf146Q5VVC0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf146Q5VVC0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf146Q5VVC0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf146Q5VVC0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf146Q5VVC0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf146Q5VVC0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf146Q5VVC0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf146Q5VVC0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf146Q5VVC0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf146Q5VVC0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf146Q5VVC0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf146Q5VVC0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms