Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C12orf60Q5U649 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
C12orf60Q5U649 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
C12orf60Q5U649 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
C12orf60Q5U649 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms