Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C6orf141Q5SZD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf141Q5SZD1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf141Q5SZD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms