Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SNAPC4Q5SXM2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SNAPC4Q5SXM2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SNAPC4Q5SXM2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SNAPC4Q5SXM2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SNAPC4Q5SXM2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SNAPC4Q5SXM2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
SNAPC4Q5SXM2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
SNAPC4Q5SXM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SNAPC4Q5SXM2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SNAPC4Q5SXM2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SNAPC4Q5SXM2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SNAPC4Q5SXM2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SNAPC4Q5SXM2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SNAPC4Q5SXM2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SNAPC4Q5SXM2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SNAPC4Q5SXM2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SNAPC4Q5SXM2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SNAPC4Q5SXM2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SNAPC4Q5SXM2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SNAPC4Q5SXM2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms