Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC6Q5RKV6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC6Q5RKV6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC6Q5RKV6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms