Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC158Q5M9N0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC158Q5M9N0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC158Q5M9N0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC158Q5M9N0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC158Q5M9N0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms