Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSD17B12Q53GQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSD17B12Q53GQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HSD17B12Q53GQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms