Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GNPTABQ3T906 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GNPTABQ3T906 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms