Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PROX2Q3B8N5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms