Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TXNRD1Q16881 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TXNRD1Q16881 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TXNRD1Q16881 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TXNRD1Q16881 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TXNRD1Q16881 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
TXNRD1Q16881 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TXNRD1Q16881 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms