Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP6Q16828 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP6Q16828 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP6Q16828 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP6Q16828 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
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