Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCK2Q16822 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCK2Q16822 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCK2Q16822 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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