Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBR1Q16650 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBR1Q16650 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBR1Q16650 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBR1Q16650 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms