Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRY1Q16526 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
CRY1Q16526 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRY1Q16526 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRY1Q16526 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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