Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NECTIN1Q15223 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NECTIN1Q15223 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NECTIN1Q15223 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NECTIN1Q15223 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NECTIN1Q15223 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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