Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL19A1Q14993 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL19A1Q14993 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL19A1Q14993 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL19A1Q14993 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
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