Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSHL1Q14406 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSHL1Q14406 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms