Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
VGLL4Q14135 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
VGLL4Q14135 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
VGLL4Q14135 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VGLL4Q14135 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms