Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARB2Q14108 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCARB2Q14108 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARB2Q14108 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARB2Q14108 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms