Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
SHROOM2Q13796 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SHROOM2Q13796 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SHROOM2Q13796 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SHROOM2Q13796 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SHROOM2Q13796 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SHROOM2Q13796 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SHROOM2Q13796 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SHROOM2Q13796 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
SHROOM2Q13796 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SHROOM2Q13796 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SHROOM2Q13796 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SHROOM2Q13796 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SHROOM2Q13796 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
SHROOM2Q13796 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
SHROOM2Q13796 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
SHROOM2Q13796 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
SHROOM2Q13796 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SHROOM2Q13796 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
SHROOM2Q13796 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SHROOM2Q13796 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SHROOM2Q13796 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
SHROOM2Q13796 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SHROOM2Q13796 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SHROOM2Q13796 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SHROOM2Q13796 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
SHROOM2Q13796 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SHROOM2Q13796 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SHROOM2Q13796 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SHROOM2Q13796 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SHROOM2Q13796 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
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