Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF5Q13568 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF5Q13568 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRF5Q13568 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRF5Q13568 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
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