Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCGQ13326 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SGCGQ13326 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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