Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK2Q13002 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK2Q13002 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
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