Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTP4A2Q12974 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTP4A2Q12974 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTP4A2Q12974 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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