Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 30.2
ILF3Q12906 RBPMS-219ENST00000523115 449 ntTSL 33.54□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 30.2
ILF3Q12906 FAM122B-206ENST00000486347 1381 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.021e-16■■■■■ 30.1
ILF3Q12906 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.55e-9■■■■■ 30
ILF3Q12906 MATR3-219ENST00000512040 642 ntTSL 34.19□□□□□ -1.745e-9■■■■■ 30
ILF3Q12906 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.796e-9■■■■■ 30
ILF3Q12906 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.676e-9■■■■■ 30
ILF3Q12906 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.066e-9■■■■■ 30
ILF3Q12906 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.256e-9■■■■■ 30
ILF3Q12906 DLEU2-204ENST00000433070 698 ntTSL 1 (best)11.63□□□□□ -0.556e-9■■■■■ 30
ILF3Q12906 DLEU2-207ENST00000458725 1657 ntTSL 211.15□□□□□ -0.626e-9■■■■■ 30
ILF3Q12906 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 29.9
ILF3Q12906 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 29.9
ILF3Q12906 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 29.9
ILF3Q12906 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 318.05■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 29.9
ILF3Q12906 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 29.9
ILF3Q12906 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.145e-8■■■■■ 29.9
ILF3Q12906 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.275e-8■■■■■ 29.9
ILF3Q12906 AP2A2-213ENST00000528815 3072 ntTSL 212.74□□□□□ -0.375e-8■■■■■ 29.9
ILF3Q12906 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 ATAD5-202ENST00000578295 4051 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 ATAD5-203ENST00000585133 2686 ntTSL 22.43□□□□□ -2.022e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 LSM14A-208ENST00000590416 699 ntTSL 216.64■□□□□ 0.259e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 MTIF3-211ENST00000485959 682 ntTSL 513.34□□□□□ -0.279e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 MTIF3-212ENST00000493719 760 ntTSL 512.82□□□□□ -0.369e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 MTIF3-207ENST00000471771 877 ntTSL 512.59□□□□□ -0.399e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 MTIF3-205ENST00000461838 947 ntTSL 311.02□□□□□ -0.659e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 MTIF3-204ENST00000460973 785 ntTSL 510.24□□□□□ -0.779e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 USP54-201ENST00000339859 6247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.779e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 LSM14A-206ENST00000588582 3601 ntTSL 29.92□□□□□ -0.829e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 MTIF3-210ENST00000485650 798 ntTSL 39.84□□□□□ -0.839e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 MTIF3-201ENST00000381116 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.859e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 USP54-207ENST00000451492 509 ntTSL 49.64□□□□□ -0.879e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 USP54-211ENST00000474929 590 ntTSL 48.11□□□□□ -1.119e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 MTIF3-202ENST00000381120 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.119e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.349e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 NR6A1-204ENST00000475178 742 ntTSL 36.55□□□□□ -1.369e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 USP54-202ENST00000413442 543 ntTSL 46.38□□□□□ -1.399e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 CBX3-206ENST00000481057 860 ntTSL 25.8□□□□□ -1.489e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 USP54-206ENST00000433394 600 ntTSL 55.34□□□□□ -1.559e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 USP54-217ENST00000498213 815 ntTSL 43.81□□□□□ -1.89e-9■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 APOO-204ENST00000490078 916 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 APOO-205ENST00000633372 1159 ntTSL 315.94■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 APOO-209ENST00000634188 713 ntTSL 43.48□□□□□ -1.856e-7■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 APOO-202ENST00000439528 714 ntTSL 23.23□□□□□ -1.896e-7■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 APOO-206ENST00000633432 437 ntTSL 52.96□□□□□ -1.946e-7■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 APOO-208ENST00000634086 461 ntTSL 32.53□□□□□ -26e-7■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)23.9■■□□□ 1.423e-7■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.58■■□□□ 1.373e-7■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 ACLY-205ENST00000588547 471 ntTSL 39.62□□□□□ -0.872e-11■■■■■ 29.8
ILF3Q12906 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 STIM1-213ENST00000532610 524 ntTSL 410.5□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 STIM1-210ENST00000528656 581 ntTSL 47.87□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 STIM1-204ENST00000525403 625 ntTSL 47.18□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 STIM1-203ENST00000525055 583 ntTSL 47.14□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 STIM1-211ENST00000530554 552 ntTSL 46.55□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 STIM1-214ENST00000532919 580 ntTSL 45.98□□□□□ -1.453e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 STIM1-202ENST00000524822 415 ntTSL 55.17□□□□□ -1.583e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.21□□□□□ -1.265e-7■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 PFKP-207ENST00000421751 658 ntTSL 415.63■□□□□ 0.094e-9■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 PFKP-204ENST00000407806 705 ntTSL 513.91□□□□□ -0.184e-9■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.824e-9■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 CR1L-205ENST00000531844 663 ntTSL 28.14□□□□□ -1.114e-9■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 DNAJC6-205ENST00000472787 519 ntTSL 33.07□□□□□ -1.924e-9■■■■■ 29.7
ILF3Q12906 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.447e-9■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 SLMAP-204ENST00000416658 1570 ntTSL 1 (best)7.04□□□□□ -1.289e-9■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 SLMAP-205ENST00000417128 3066 ntTSL 1 (best)6.41□□□□□ -1.389e-9■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 SLMAP-207ENST00000438794 2274 ntTSL 1 (best)5.16□□□□□ -1.589e-9■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 SLMAP-216ENST00000475055 351 ntTSL 34.04□□□□□ -1.769e-9■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 SLMAP-212ENST00000465203 511 ntTSL 53.99□□□□□ -1.779e-9■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 SLMAP-215ENST00000472546 559 ntTSL 43.71□□□□□ -1.829e-9■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 SLMAP-209ENST00000459654 579 ntTSL 43.66□□□□□ -1.829e-9■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 MAGI3-206ENST00000486456 897 ntTSL 519.95■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-8■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 SMPD4P1-201ENST00000416717 2263 ntBASIC10.22□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 SMPD4P1-203ENST00000443839 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 29.6
ILF3Q12906 CELF1-221ENST00000543178 576 ntTSL 49.39□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 29.5
ILF3Q12906 CELF1-212ENST00000528538 581 ntTSL 49□□□□□ -0.979e-7■■■■■ 29.5
ILF3Q12906 CELF1-211ENST00000528434 543 ntTSL 55.33□□□□□ -1.569e-7■■■■■ 29.5
ILF3Q12906 CELF1-209ENST00000526277 556 ntTSL 45.01□□□□□ -1.619e-7■■■■■ 29.5
ILF3Q12906 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 29.5
ILF3Q12906 MAGI2-216ENST00000628997 641 ntTSL 313.54□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 MAGI2-226ENST00000636424 102 ntTSL 52.92□□□□□ -1.943e-7■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.222e-11■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 TJP2-211ENST00000636247 3725 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.472e-11■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-11■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 MRPL42-207ENST00000551396 725 ntTSL 54.55□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 MRPL42-209ENST00000552326 567 ntTSL 44.36□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.751e-7■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 MRPL42-201ENST00000358678 2105 ntTSL 1 (best)3.8□□□□□ -1.82e-7■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 MRPL42-205ENST00000549561 775 ntTSL 33.77□□□□□ -1.812e-7■■■■■ 29.4
ILF3Q12906 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.052e-7■■■■■ 29.4
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 558.5 ms