RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493719.5

MTIF3-212, Transcript of mitochondrial translational initiation factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene MTIF3, Length 760 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3-212ENST00000493719 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.71■■■□□ 2.83
MTIF3-212ENST00000493719 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
MTIF3-212ENST00000493719 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.71■■■□□ 2.35
MTIF3-212ENST00000493719 ABCC9O60706 1549 aa29.7■■■□□ 2.34
MTIF3-212ENST00000493719 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.45■■■□□ 2.3
MTIF3-212ENST00000493719 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.11■■■□□ 2.09
MTIF3-212ENST00000493719 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.05■■■□□ 2.08
MTIF3-212ENST00000493719 NACADO15069 1562 aa27.84■■■□□ 2.05
MTIF3-212ENST00000493719 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.65■■■□□ 2.02
MTIF3-212ENST00000493719 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.61■■■□□ 2.01
MTIF3-212ENST00000493719 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
MTIF3-212ENST00000493719 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.39■■□□□ 1.97
MTIF3-212ENST00000493719 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.36■■□□□ 1.97
MTIF3-212ENST00000493719 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
MTIF3-212ENST00000493719 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.95■■□□□ 1.91
MTIF3-212ENST00000493719 SCRIBQ14160 1630 aa26.9■■□□□ 1.9
MTIF3-212ENST00000493719 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.85■■□□□ 1.89
MTIF3-212ENST00000493719 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.81■■□□□ 1.88
MTIF3-212ENST00000493719 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.73■■□□□ 1.87
MTIF3-212ENST00000493719 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
MTIF3-212ENST00000493719 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
MTIF3-212ENST00000493719 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
MTIF3-212ENST00000493719 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.81■■□□□ 1.72
MTIF3-212ENST00000493719 NCAPD3P42695 1498 aa25.7■■□□□ 1.7
MTIF3-212ENST00000493719 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.63■■□□□ 1.69
MTIF3-212ENST00000493719 CUX2O14529 1486 aa25.6■■□□□ 1.69
MTIF3-212ENST00000493719 ERCC6Q03468 1493 aa25.6■■□□□ 1.69
MTIF3-212ENST00000493719 SMARCA4P51532 1647 aa25.59■■□□□ 1.69
MTIF3-212ENST00000493719 HMGXB3Q12766 1538 aa25.53■■□□□ 1.68
MTIF3-212ENST00000493719 SMARCA2P51531 1590 aa25.52■■□□□ 1.68
MTIF3-212ENST00000493719 NESP48681 1621 aa25.48■■□□□ 1.67
MTIF3-212ENST00000493719 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
MTIF3-212ENST00000493719 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MTIF3-212ENST00000493719 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.31■■□□□ 1.64
MTIF3-212ENST00000493719 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
MTIF3-212ENST00000493719 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.25■■□□□ 1.63
MTIF3-212ENST00000493719 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.18■■□□□ 1.62
MTIF3-212ENST00000493719 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.16■■□□□ 1.62
MTIF3-212ENST00000493719 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.98■■□□□ 1.59
MTIF3-212ENST00000493719 WIZO95785 1651 aa24.96■■□□□ 1.59
MTIF3-212ENST00000493719 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.91■■□□□ 1.58
MTIF3-212ENST00000493719 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.85■■□□□ 1.57
MTIF3-212ENST00000493719 WDR62O43379 1518 aa24.81■■□□□ 1.56
MTIF3-212ENST00000493719 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.7■■□□□ 1.55
MTIF3-212ENST00000493719 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.67■■□□□ 1.54
MTIF3-212ENST00000493719 TRIM41Q8WV44 630 aa24.64■■□□□ 1.54
MTIF3-212ENST00000493719 CFTRP13569 1480 aa24.61■■□□□ 1.53
MTIF3-212ENST00000493719 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
MTIF3-212ENST00000493719 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
MTIF3-212ENST00000493719 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
MTIF3-212ENST00000493719 PRDM2Q13029 1718 aa24.41■■□□□ 1.5
MTIF3-212ENST00000493719 OSCARQ8IYS5 282 aa24.34■■□□□ 1.49
MTIF3-212ENST00000493719 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.29■■□□□ 1.48
MTIF3-212ENST00000493719 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
MTIF3-212ENST00000493719 TOPBP1Q92547 1522 aa24.2■■□□□ 1.46
MTIF3-212ENST00000493719 IFT140Q96RY7 1462 aa24.19■■□□□ 1.46
MTIF3-212ENST00000493719 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.19■■□□□ 1.46
MTIF3-212ENST00000493719 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.19■■□□□ 1.46
MTIF3-212ENST00000493719 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.19■■□□□ 1.46
MTIF3-212ENST00000493719 FOXD1Q16676 465 aa24.18■■□□□ 1.46
MTIF3-212ENST00000493719 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
MTIF3-212ENST00000493719 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.1■■□□□ 1.45
MTIF3-212ENST00000493719 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.08■■□□□ 1.45
MTIF3-212ENST00000493719 ARHGEF11O15085 1522 aa24.06■■□□□ 1.44
MTIF3-212ENST00000493719 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
MTIF3-212ENST00000493719 ABCC8Q09428 1581 aa24.02■■□□□ 1.44
MTIF3-212ENST00000493719 CHD1O14646 1710 aa24.01■■□□□ 1.43
MTIF3-212ENST00000493719 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.436e-9■■■■■ 45.1
MTIF3-212ENST00000493719 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
MTIF3-212ENST00000493719 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.87■■□□□ 1.41
MTIF3-212ENST00000493719 ARAP1Q96P48 1450 aa23.84■■□□□ 1.41
MTIF3-212ENST00000493719 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.84■■□□□ 1.41
MTIF3-212ENST00000493719 FBLN2P98095 1184 aa23.81■■□□□ 1.4
MTIF3-212ENST00000493719 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
MTIF3-212ENST00000493719 SOGA1O94964 1423 aa23.77■■□□□ 1.4
MTIF3-212ENST00000493719 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.76■■□□□ 1.39
MTIF3-212ENST00000493719 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.75■■□□□ 1.39
MTIF3-212ENST00000493719 CUX1P39880 1505 aa23.74■■□□□ 1.39
MTIF3-212ENST00000493719 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.69■■□□□ 1.38
MTIF3-212ENST00000493719 WDR97A6NE52 1622 aa23.67■■□□□ 1.38
MTIF3-212ENST00000493719 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
MTIF3-212ENST00000493719 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
MTIF3-212ENST00000493719 SYNJ1O43426 1573 aa23.61■■□□□ 1.37
MTIF3-212ENST00000493719 GRIN2BQ13224 1484 aa23.6■■□□□ 1.37
MTIF3-212ENST00000493719 PBRM1Q86U86 1689 aa23.58■■□□□ 1.37
MTIF3-212ENST00000493719 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
MTIF3-212ENST00000493719 SYNJ2O15056 1496 aa23.55■■□□□ 1.36
MTIF3-212ENST00000493719 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.49■■□□□ 1.35
MTIF3-212ENST00000493719 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.49■■□□□ 1.35
MTIF3-212ENST00000493719 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.45■■□□□ 1.34
MTIF3-212ENST00000493719 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.37■■□□□ 1.33
MTIF3-212ENST00000493719 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
MTIF3-212ENST00000493719 ADAMTS12P58397 1594 aa23.33■■□□□ 1.33
MTIF3-212ENST00000493719 GRIN2AQ12879 1464 aa23.32■■□□□ 1.32
MTIF3-212ENST00000493719 CEP170Q5SW79 1584 aa23.31■■□□□ 1.32
MTIF3-212ENST00000493719 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.29■■□□□ 1.32
MTIF3-212ENST00000493719 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
MTIF3-212ENST00000493719 TOP2BQ02880 1626 aa23.26■■□□□ 1.31
MTIF3-212ENST00000493719 NUP160Q12769 1436 aa23.25■■□□□ 1.31
MTIF3-212ENST00000493719 SHROOM2Q13796 1616 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.4 ms