Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLFN5Q08AF3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLFN5Q08AF3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SLFN5Q08AF3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLFN5Q08AF3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLFN5Q08AF3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLFN5Q08AF3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLFN5Q08AF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SLFN5Q08AF3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLFN5Q08AF3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SLFN5Q08AF3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLFN5Q08AF3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLFN5Q08AF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLFN5Q08AF3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms