Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TGM3Q08188 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TGM3Q08188 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TGM3Q08188 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGM3Q08188 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms