Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABPB1Q06547 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABPB1Q06547 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABPB1Q06547 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABPB1Q06547 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms