Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNP2Q05952 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNP2Q05952 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms