Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCZQ05513 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCZQ05513 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCZQ05513 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms