Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PPARDQ03181 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PPARDQ03181 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARDQ03181 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPARDQ03181 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARDQ03181 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms