Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC25A11Q02978 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC25A11Q02978 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC25A11Q02978 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms